我校前身国立中正大学创建于1940年，当时有无专门的档案室，由于档案的缺失，已不可考，但是档案工作是有人兼做的，因为当时的档案留存下来了，现全部保存在江西省档案馆。1949年5月，南昌解放。1949年8月，国立中正大学更名为南昌大学，从南昌大学时期的一份档案——《南昌大学校部平面图》可以看出，南昌大学是有专门的档案室的。具体情况也已不可考。

        1953年，全国高等院校实行院系调整，根据统一部署，南昌大学的绝大部分系科被调整到外省的高校中，以留下的师范部为基础，成立江西师范学院。刚成立时，学校还没有专门的档案室，国立中正大学、工专、农专、体专、南昌大学的文书档案虽已立卷，但只是临时保存在院办公室。江西师院成立以来的文书档案，没有专职档案人员管理，由党、政、工、团分别保管。教学档案和科学研究档案既不完整，且由教务处和各系分别保存，档案管理也不很规范。

        1990年12月29日，学校发文，将学校档案室更名为综合档案室，仍为科级建制，隶属于校长办公室。

        1993年11月，原国家教委颁布6号令《高等学校实体分类法》与《高等学校档案工作规范》，规定自1994年1月1日起施行。从1994年开始，综合档案室就按照《高等学校实体分类法》与《高等学校档案工作规范》进行分类、整理档案，包括党群、行政、教学、科研、外事、出版、基建、财会等十大类，除此之外，还有照片档案。

        2000年6月，受国家档案局委托，江西省档案局组织评审组，对我校档案工作进行检查评估，由国家档案局授予我校科技事业单位档案管理二级单位称号。2000年12月，国家档案局颁布《归档文件整理规则》，规定从2001年起，机关、团体等部门的文书档案采用以件为单位的形式整理、分类、装订等，以减少工作人员的劳动强度。我校党群、行政类档案从2001年开始以件为单位归档。其它类的档案仍以卷为单位归档。

        2001年7月3日，学校发文成立档案馆，处级建制，撤销校办综合档案室，原由党委组织部管理的干部人事档案划归档案馆管理。此后，档案馆陆续添置了电脑、打印机等设备。

        2003年12月，档案馆购买了南京大学研制开发的“南大之星”档案管理软件，2004年上半年开始使用，从此结束了手工整理及查阅档案的历史，大大地提高了工作效率，减少了劳动强度，为档案管理信息化打下了良好的基础。

        2007年6月，档案馆由青山湖校区搬迁到瑶湖校区图文信息中心，全馆面积达到约2000㎡，划分为库房、办公、技术用房等功能区，还有一间面积数百平方米的校史陈列馆，极大地拓展了空间，改善了保管条件。暑期，原江西金融职工大学档案搬迁到青山湖校区老库房。至此，校档案馆保管了两个全宗的档案：江西师范大学全宗、江西金融职工大学全宗。

        2007年下半年，2005级学生档案移交给档案馆，至此，档案馆保管了原国家教委6号令规定的高校十大类档案、照片档案及干部人事档案、学生档案。

        档案馆现有工作人员8人，其中博士研究生1人，档案专业研究生2人。档案系列正高职称1人，副高职称3人。